Die organisierte Förderung des Obstbaus reicht weit ins 19. Jahrhundert zurück. So waren in den Bezirken Schongau und Weilheim bereits die Obstbausektionen der landwirtschaftlichen Bezirksvereine Schongau und Weilheim aktiv.
Die Gründung der Bezirksobstbauverbände sowie der Obstbauvereine in möglichst vielen Orten war eine staatliche Zielsetzung, mit der man einerseits die große Einfuhr von Obst verringern, andererseits die bessere und ausgeglichenere Ernährung der Bevölkerung sichern wollte. Mit der Gründung der Bezirksobstbauverbände endete die Tätigkeit der Obstbausektionen. Im Zuge dieser Aufbruchsstimmung erfolgte auch die Gründung des Peißenberger Vereins.

So trafen sich am Sonntag, dem 4. September 1904 Peißenberger Obstgartenbesitzer um 14 Uhr im Gasthaus „Zur Post". Grund war ein Aufruf des Bürgermeisters Ulrich Schwaller, der sich seinerseits auf ein vom 14. Juli 1904 datiertes Schreiben des landwirtschaftlichen Bezirksvereins Weilheim an die Gemeinde Unterpeißenberg bezog. Der Obstbau sollte gefördert und Voraussetzungen für eine gute heimische Obsternte geschaffen werden. Gleich bei diesem ersten Treffen wurde der Verein

Die kommenden Jahre brachten den 1. Weltkrieg, Inflation und Arbeitslosigkeit, so dass auch hier auf dem Land die Not spürbar war und die Eigenversorgung mit Obst und Gemüse eine große Rolle spielte. Der Verein trug dieser Entwicklung Rechnung und nahm sich auch des Gemüsebaus intensiver an. Am 9. März 1922 wurde Gärtnermeister Ludwig Ferchl erstmals zum Vorstand gewählt - er sollte sein Amt bis 1943 ausüben.

Ziel war, die neuen Pflanzenschutzmittel bekannt zu machen, Schnitt- und Pflanzkurse zu veranstalten und sich an Obstausstellungen in Peißenberg und Umgebung zu beteiligen. Seit 1920 stand Siegmund Auer aus Weilheim als Fachberater zur Seite.

Mit Beginn des Dritten Reiches änderte sich das Vereinsleben. 1934 wurden die Mitglieder zu „Erzeugungsschlachten" aufgerufen, seit 1936 waren die Gartenbauvereine dem „Reichsnährstand" angegliedert. Die Vorstände wurden nun nicht mehr gewählt, sondern bestellt. Die Gartenbesitzer waren verpflichtet, die Obstbäume zu pflegen und die Schädlingsbekämpfung musste überwacht werden. Herr Auer war unermüdlich aufklärend tätig. Es wurden immer wieder Blütenschauen veranstaltet und Neuanlagen von Obstpflanzungen vorbereitet (u.a. 1942/43 bei Peter Höck, Böbinger Straße). Die Förderung des Gemüsebaus fand ihren Ausdruck in Mustergärten, einer davon entstand bei Ludwig Sendl, Forster Straße.

Langsam stieg der Wohlstand der Bevölkerung wieder an und das Interesse am intensiven Obst- und Gemüseanbau ließ entsprechend nach. Es begann die Zeit der Nadelgehölze im Ziergarten, der gepflegte Rasen, gezirkelte Blumenbeete galten als hobbygärtnerisches Ideal und besonders der Gemüseanbau verlor wieder an Bedeutung. Mit weniger Arbeitsaufwand als früher erzielte man durch den Einsatz von viel Dünger und viel Spritzmitteln reiche Ernten, an Gesundheits- oder gar Umweltschäden dachten damals aber die wenigsten. Der Verein bemühte sich, mit der modernen Entwicklung Schritt zu halten und verlegte sich u.a. auf die fast jährliche Durchführung von Blumenschmuckwettbewerben, die allgemein großen Anklang fanden und sogar von der Gemeinde gefördert wurden.
Das Interesse an der Obstverwertung war so groß geblieben, dass man 1951 den zweiten Teil des Presshauses baute, um die Anlage zu modernisieren. Diese Obstpresse tat dann bis 1983 ihren Dienst.

Bei den 1968 anstehenden Neuwahlen gab es erneut eine Veränderung an der Vereinsspitze. Mit der Berufung von Wilfried Raab bekam der Verein wieder einen ausgebildeten Gartenfachmann als Vorstand, sein Stellvertreter wurde Karl Welzmüller. Raab führte regelmäßige Treffen ein und gab sein großes Fachwissen an die Interessenten weiter, bot Kurse und Vorträge an, führte Informationsfahrten zu lohnenden Zielen durch. Seit Beginn seiner Amtszeit ermöglicht er über den Gartenbauverein den Besuch nahezu aller Landesgartenschauen, organisiert Stadtführungen, Ausflüge und vieles mehr.
Im Trend der Zeit wurde 1985 ein Komposthäcksler angeschafft, der an die Mitglieder ausgeliehen wurde. Leider zeigte sich, dass das Gerät offenbar nicht immer sachgemäß betrieben wurde. Die dadurch entstandenen hohen Reparaturkosten veranlassten den Verein letztlich dazu, das „Unternehmen Häcksler" wieder aufzugeben.
Seit 1986 ist der Verein vom Finanzamt als gemeinnützig anerkannt.
Ab 1987 war der Gartenbauverein nahezu jedes Jahr mit einem stets anders gestalteten Festwagen bei der Leonhardifahrt vertreten. An den letzten Hobbyausstellungen der VHS beteiligte sich der Verein mit großem Erfolg, ebenso an den Erntedankausstellungen des Kreisverbandes in Weilheim.
1983 schaffte man die derzeit betriebene Obstpressanlage an, die 1997 durch die Erhitzungs- und Abfüllanlage ergänzt wurde. Das Interesse an dieser modernen Form der Saftgewinnung ist groß.

Der Gartenbauverein konnte in den vergangenen Jahren den Gartenbesitzern neue Erkenntnisse vermitteln. Man bemühte sich, durch umfassende Aufklärung den Einsatz von Chemie im Hausgarten zu reduzieren und ökologisch sinnvolles und verträgliches Gärtnern zu erklären. Die Erkenntnisse über das Düngeverhalten hatten sich im Lauf der Zeit geändert und man versuchte, in einem breit gefächerten Angebot von Vorträgen und Kursen Mitgliedern und Nichtmitgliedern Hilfestellung anzubieten.

Am 23.02.2005 wurde Matthias Hett zum 1. Vorsitzenden gewählt.
Unter der Leitung von Matthias Hett erhielt die Vereinssatzung eine neue und zeitgemäße Fassung. Die Miet-/Pachtverträge mit der Pfarrpfründestiftung St. Johann Baptist und den Untermietverträgen „Grünes Klassenzimmer“, Grundschule St. Johann / Markt Peißenberg und dem örtlichen Bienenzuchtverein mit deren „Lehrbienenstand“ wurden rechtlich/vertraglich gut und sicher mit allen Vertragspartnern für die Zukunft abgeschlossen.